Las áreas de especialización del Dr. Ibarra-Yúnez son comercio y finanzas Internacionales, modelos económicos, organización industrial y regulaciones, econometría, economía latinoamericana, bloques comerciales y acuerdos comerciales. En los últimos años, su investigación se ha orientado a las áreas de contratos imperfectos en la integración internacional, problemas de daño moral (moral hazard), teoría de juegos y sectores en red (telecomunicaciones, infraestructura, transporte, energía, banca, subcontratación de multinacionales). Su profundo conocimiento en redes y regulaciones le ha valido los cargos de Director de la cátedra Economías en Red y Regulaciones Económicas del Tecnológico de Monterrey, de la cátedra Center for Studies of Western Hemispheric Trade en la Universidad de Texas en Austin (EE.UU) –donde también ejerce como profesor de International Integration y Economic Problems and Policies of Latin America desde 1994—, y del proyecto Economic and Regulatory Challenges and Opportunities for US-Mexico Electricity Trade and Cooperation en la LBJ School of Public Affairs – institución donde también ha sido profesor visitante—.
